Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC126177.2-201ENST00000552154 452 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SCN5AQ14524 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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