Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-1037P-201ENST00000459571 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
SPIDRQ14159 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
SPIDRQ14159 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms