Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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UBE4AQ14139 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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UBE4AQ14139 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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UBE4AQ14139 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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UBE4AQ14139 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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UBE4AQ14139 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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UBE4AQ14139 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
UBE4AQ14139 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
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UBE4AQ14139 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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UBE4AQ14139 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 EEF1B2P7-201ENST00000451177 676 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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UBE4AQ14139 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
UBE4AQ14139 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
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