Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC245054.2-201ENST00000415639 319 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
CKAP5Q14008 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms