Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PKP1Q13835 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PKP1Q13835 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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