Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CUL3Q13618 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CUL3Q13618 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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