Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC004936.1-201ENST00000451755 361 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
PEX6Q13608 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms