Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 PCDH11X-206ENST00000373097 9146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
SMAD4Q13485 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
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