Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC0.9□□□□□ -2.26
TCOF1Q13428 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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TCOF1Q13428 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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TCOF1Q13428 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
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TCOF1Q13428 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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TCOF1Q13428 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
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TCOF1Q13428 BIRC6-AS1-201ENST00000455572 697 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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TCOF1Q13428 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TCOF1Q13428 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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