Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
GRIN2BQ13224 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU6-1280P-201ENST00000365211 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC018926.1-201ENST00000616335 435 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU6-1183P-201ENST00000517054 60 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
GRIN2BQ13224 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
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