Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 PMCHL2-203ENST00000457791 237 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 CASP3-203ENST00000393588 677 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL356361.2-201ENST00000430542 443 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CBX3Q13185 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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