Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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RPA4Q13156 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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RPA4Q13156 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
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RPA4Q13156 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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RPA4Q13156 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
RPA4Q13156 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RPA4Q13156 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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