Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC022784.2-201ENST00000521298 328 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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CSTF3Q12996 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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