Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
HOXD13P35453 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
HOXD13P35453 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.7 ms