Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL118556.1-201ENST00000555257 502 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRMP28827 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.1 ms