Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

Predictions only

Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SSR1P1-201ENST00000407630 814 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC022432.1-201ENST00000595739 310 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 SNORD115-41-201ENST00000363608 82 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PKHD1P08F94 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
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