Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
CTIFO43310 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CTIFO43310 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC114501.3-201ENST00000453648 164 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CTIFO43310 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CTIFO43310 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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