Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 LINC01807-201ENST00000432481 676 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ERVV-1B6SEH8 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
ERVV-1B6SEH8 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms