Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Speer3W4VSP1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Speer3W4VSP1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms