Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z266

Snapin, SNARE-associated protein Snapin, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnapinQ9Z266 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SnapinQ9Z266 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnapinQ9Z266 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SnapinQ9Z266 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SnapinQ9Z266 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms