Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Shcbp1Q9Z179 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Shcbp1Q9Z179 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms