Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pacsin2Q9WVE8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pacsin2Q9WVE8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms