Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tnnt3Q9QZ47 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tnnt3Q9QZ47 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms