Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Snai3Q9QY31 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Snai3Q9QY31 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms