Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Trim2Q9ESN6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Trim2Q9ESN6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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