Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J8

Bpifa3, BPI fold-containing family A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bpifa3Q9D9J8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Bpifa3Q9D9J8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Bpifa3Q9D9J8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms