Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Trappc6bQ9D289 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Trappc6bQ9D289 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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