Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx7Q9CY18 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx7Q9CY18 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms