Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhl28Q9CR40 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhl28Q9CR40 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms