Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riok2Q9CQS5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Riok2Q9CQS5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms