Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nus1Q99LJ8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms