Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y12

Pcdha8, Protocadherin alpha 8, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha8Q91Y12 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pcdha8Q91Y12 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pcdha8Q91Y12 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms