Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cnppd1Q8K158 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Cnppd1Q8K158 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnppd1Q8K158 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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