Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms