Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN16

Hhip, Hedgehog-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HhipQ7TN16 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HhipQ7TN16 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HhipQ7TN16 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms