Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Rbm38Q62176 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Rbm38Q62176 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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