Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

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Length 77 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
SvipQ3UZP4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 AC154352.1-201ENSMUST00000221477 2365 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
SvipQ3UZP4 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
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