Protein–RNA interactions for Protein: Q3U285

Lcorl, Ligand-dependent nuclear receptor corepressor-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorlQ3U285 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LcorlQ3U285 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms