Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ZFHX3Q15911 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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