Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NrepQ07475 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms