Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Irx1P81068 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms