Protein–RNA interactions for Protein: P63276

Rps17, 40S ribosomal protein S17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps17P63276 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps17P63276 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Rps17P63276 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms