Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps5P59438 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Hps5P59438 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps5P59438 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hps5P59438 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms