Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TfamP40630 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TfamP40630 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TfamP40630 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TfamP40630 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.7 ms