Protein–RNA interactions for Protein: P34056

Tfap2a, Transcription factor AP-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2aP34056 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfap2aP34056 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfap2aP34056 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms