Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
POLD1P28340 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
POLD1P28340 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
POLD1P28340 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
POLD1P28340 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
POLD1P28340 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms