Protein–RNA interactions for Protein: P19783

Cox4i1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox4i1P19783 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cox4i1P19783 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cox4i1P19783 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms