Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tgfb1P04202 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tgfb1P04202 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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