Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Casp8O89110 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms