Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Syngr2O55101 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Syngr2O55101 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms